NGS технологии в системе мониторинга биологических угроз

Освойте передовые технологии высокопроизводительного секвенирования (NGS) в рамках очного интенсива, разработанного в поддержку федерального проекта «Санитарный щит». Программа направлена на подготовку специалистов для проактивного мониторинга вирусных возбудителей инфекционных заболеваний человека, с целью укрепления системы биологической безопасности и защиты населения страны

36

часов

36

баллов НМО

39 000 ₽

НДС не облагается

Подать заявку

Даты проведения курса

Описание курса

Формат обучения

Очный на базе ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора

Продолжительность

36 академических часов (5 рабочих дней по 7,2 академ. часа в день)

Виды учебных занятий

Лекции от ведущих экспертов в области молекулярно-генетических исследований, семинары, практические занятия на реальных кейсах и доступом к методическим материалам

Почему этот курс актуален?

Курс разработан для эффективного внедрения геномных технологий в повседневную практику эпидемиологического надзора и практического здравоохранения как на местном, так и на глобальном уровне, создавая кадры для борьбы с биологическими угрозами

Что вы получите, пройдя этот курс?

Системные знания в области геномного надзора, включая формирование навыков анализа и интерпретации данных высокопроизводительного секвенирования (NGS) для отслеживания механизмов и динамики передачи значимых патогенов, эпидемиологического расследования вспышек и выявления генетических вариантов, имеющих потенциальное эпидемиологическое и клиническое значение
Профессиональные компетенции: готовность к эффективной организации работы лабораторий высокого уровня биологической безопасности, внедряющих или использующих NGS в практических исследованиях и эпидемиологическом мониторинге инфекционных заболеваний
Документальное подтверждение: удостоверение о повышении квалификации установленного образца от ФБУН ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, подтверждающее ваш профессиональный уровень
Личностные результаты: уверенность в профессиональной деятельности, владение современным оборудованием и программными решениями, а также глубокое понимание всех этапов NGS-анализа – от пробоподготовки до интерпретации данных NGS

Кому подойдет программа:

Специалист с высшим медицинским образованием по одной из следующих специальностей: Клиническая лабораторная диагностика, Бактериология, Вирусология, Генетика, Лабораторная генетика, Медико-профилактическое дело, Медицинская биохимия, Медицинская микробиология, Паразитология, Эпидемиология.
Специалист с высшим немедицинским образованием, занимающий должность биолога или химика-эксперта медицинской организации и участвующий в выполнении лабораторных исследований
Сотрудник Роспотребнадзора, научно-исследовательского института или лаборатории высокого уровня биологической безопасности, независимо от профиля, заинтересованный в углублённом изучении NGS-технологий, применяемых в практической деятельности учреждений Роспотребнадзора.

Требования к слушателям:

Наличие высшего профессионального образования (медицинского или немедицинского профиля)
Знание методов полимеразной цепной реакции (ПЦР) и практические навыки её применения
Готовность к освоению и внедрению современных геномных технологий в профессиональную деятельность

Программа курса

Программа включает 3 модуля, охватывающих ключевые аспекты NGS-технологий:

Основы молекулярной биологии для задач высокопроизводительного секвенирования
Платформы для высокопроизводительного секвенирования
Стратегии секвенирования геномов патогенов. Примеры секвенирования патогенов на различных NGS платформах
Методы пробоподготовки для NGS. Ошибки и проблемы NGS. Области применения NGS в эпидемиологии и диагностике
Практическое занятие: подготовка биологических проб к секвенированию, запуск секвенатора

Основы биоинформатического анализа (форматы данных секвенирования, геномные базы данных, выбор праймеров, таксономия микроорганизмов)
Картирование на референс и сборка консенсуса. Сборка de novo
Практическое занятие: установка и настройка ОС Linux, работа в командной строке, запуск базовых биоинформатических инструментов
Практическое занятие: работа с геномными базами данных, использование геномного браузера, построение выравниваний и филогенетических деревьев, сборка консенсусных последовательностей
Лекция и практическое занятие: анализ метагеномных данных — выявление патогенов в сложных образцах

Геномный мониторинг SARS-CoV-2. Информационная платформа VGARus
Секвенирование геномов вирусов гепатитов B и С для задач эпидемиологического надзора
Применение геномного секвенирования в эпидемиологическом надзоре за вирусными инфекциями

Наши преимущества

Программа построена вокруг геномной эпидемиологии – ключевого инструмента современного эпидемиологического надзора, позволяющего оперативно выявлять вспышки, отслеживать пути распространения патогенов и оценивать изменения эпидемиологической ситуации
Программа учитывает действующие нормативные правовые акты, санитарные правила, методические документы и профессиональные требования, регламентирующие соответствующие направления деятельности
Только практически значимые знания и навыки, необходимые для работы в лабораториях высокого уровня биологической безопасности

Курс разработан в одном из ведущих научно‑исследовательских институтов страны – в Центре геномных исследований мирового уровня
Лекции и практикумы ведут ведущие учёные и практикующие специалисты ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора – кандидаты биологических наук, непосредственно участвующие в национальных программах мониторинга (включая SARS-CoV-2, вирусные гепатиты, другие вирусные инфекции)

Курс охватывает все этапы технологии NGS: от пробоподготовки образцов до биоинформатики и интерпретации данных
Включает современные подходы: анализ метагеномных данных, выявление патогенов неясной этиологии, применение методов машинного обучения и элементов структурной биологии

Возможность пройти курс за счёт работодателя или за собственные средства
Доступная стоимость при высоком уровне подготовки – с учётом масштабов и насыщенности программы
Возможность оформления налогового вычета (13 % от стоимости обучения по программам ДПО)

Преподаватели обеспечивают оперативную обратную связь на всех этапах обучения
Поддержка продолжается и после завершения курса – в рамках профессионального сообщества выпускников

Очный интенсив – 5 дней полного погружения в практику
Занятия проходят на современной научной базе с доступом к оборудованию, программному обеспечению и реальным кейсам

Преподаватели

Хафизов Камиль Фаридович

Заведующий лабораторией геномных исследований ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора.
Главный научный сотрудник Центра геномных исследований мирового уровня по обеспечению биологической безопасности и технологической независимости

Кандидат биологических наук, PhD в геномике

Чанышев Михаил Дамирович

Руководитель научной группы прикладной геномики и секвенирования вирусных патогенов лаборатории геномных исследований ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора

Надтока Максим Игоревич

Руководитель научной группы фундаментальных и прикладных геномных исследований лаборатории геномных исследований ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора

Роев Герман Викторович

Биоинформатик лаборатории геномных исследований ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора

Пимкина Екатерина Владимировна

Научный сотрудник лаборатории геномных исследований ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора

Бухарина Анна Юрьевна

Научный сотрудник лаборатории геномных исследований ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора

Аглетдинов Матвей Рашидович

Руководитель научной группы разработки биоинформатических систем лаборатории геномных исследований ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора

Как начать обучение

Выберите подходящий способ оплаты – от физического лица или юридического лица, а также удобную дату начала обучения, заполните форму на сайте

Мы оперативно подготовим договор и выставим счёт. Для удобства физических лиц предусмотрена система оплаты через QR-код. Ваша задача – внимательно ознакомиться с условиями и подписать документы

В назначенную дату мы ждем вас на занятиях. За день до старта вы получите на email: подробное расписание, инструкцию по проходу на территорию института, список рекомендаций (что взять с собой)

Дополнительные бонусы

Удостоверение о повышении квалификации

по окончании курса вы получите документ об образовании установленного образца – удостоверение о повышении квалификации, данные которого будут внесены в ФИС ФРДО

Баллы НМО

для получения баллов Вам необходимо подать заявку на цикл на портале НМФО и успешно пройти итоговую аттестацию (будет начислено 36 ЗЕТ (баллов НМО) в системе непрерывного медицинского образования)

Поддержка преподавателей на всех этапах

на протяжении всего курса преподаватели будут на связи, готовые ответить на любые ваши вопросы и помочь разобраться в сложных моментах до, во время и после занятий

Что входит в стоимость обучения?

Стоимость курса включает: очные занятия по программе, доступ к лабораторному оборудованию, практические работы и учебные материалы, обед в столовой института, выдачу удостоверения о повышении квалификации. Стоимость проживания, командировочные и транспортные расходы не входят в стоимость обучения и осуществляются за счет командирующей стороны

Какие требования предъявляются к слушателям?

Для успешного освоения программы необходимо иметь высшее профессиональное образование (медицинское или немедицинское), обладать теоретическими знаниями и практическими навыками в области полимеразной цепной реакции (ПЦР). По окончании курса необходимо пройти итоговую аттестацию в формате тестирования.